RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, human

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UPP1-208	ENST00000436673	PHKA1	P46020	1223 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	DCAF15	Q66K64	600 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	FAM151A	Q8WW52	585 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	SLC34A2	O95436	690 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	CAP1	Q01518	475 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	EFCC1	Q9HA90	598 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		32.88	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	CENPF	P49454	3210 aa		32.87	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	ZBTB22	O15209	634 aa		32.87	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		32.87	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	ADORA1	P30542	326 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	CETP	P11597	493 aa		32.85	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	NFIA	Q12857	509 aa		32.85	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	IRF6	O14896	467 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	TCP10	Q12799	353 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	PPIL2	Q13356	520 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	CCDC102B	Q68D86	513 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	GNAI3	P08754	354 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	INPP5B	P32019	993 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	SNAPC2	Q13487	334 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	USP40	Q9NVE5	1235 aa		32.83	■■■□□ 2.85
UPP1-208	ENST00000436673	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		32.82	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		32.82	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	BTBD19	C9JJ37	291 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	TIMM10	P62072	90 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	PPAT	Q06203	517 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	MTX1	Q13505	466 aa		32.81	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	ARMC5	Q96C12	935 aa		32.8	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	RASGRF1	Q13972	1273 aa		32.79	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	TLR2	O60603	784 aa		32.78	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	ARHGEF6	Q15052	776 aa		32.78	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	GAK	O14976	1311 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673		A0A1B0GUL7	405 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	POTEF	A5A3E0	1075 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	TRIM27	P14373	513 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	TFCP2	Q12800	502 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		32.77	■■■□□ 2.84
UPP1-208	ENST00000436673	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	XAGE2	Q96GT9	111 aa		32.76	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	IDI2	Q9BXS1	227 aa		32.75	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	ABCF2	Q9UG63	623 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	BRCA2	P51587	3418 aa		32.73	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		32.73	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	BCAR3	O75815	825 aa		32.73	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	RGS3	P49796	1198 aa		32.73	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	ENTPD3	O75355	529 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	GNAI2	P04899	355 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	SLF2	Q8IX21	1173 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		32.71	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF333	Q96JL9	665 aa		32.7	■■■□□ 2.83
UPP1-208	ENST00000436673	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	MOGS	Q13724	837 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	C17orf99	Q6UX52	265 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	AK9	Q5TCS8	1911 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	PDHX	O00330	501 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	KIF22	Q14807	665 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	BTD	P43251	543 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		32.67	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	MAP3K10	Q02779	954 aa		32.66	■■■□□ 2.82
UPP1-208	ENST00000436673	MECOM	Q03112	1051 aa		32.66	■■■□□ 2.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms