RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434435.1

SMARCAL1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1, human

TSL 4

Gene SMARCAL1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GLTPD2	A6NH11	291 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PLCG2	P16885	1265 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PPP4C	P60510	307 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LCORL	Q8N3X6	602 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ARMT1	Q9H993	441 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MYH1	P12882	1939 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435		H7C1D1	291 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	REC8	O95072	547 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LAMA4	Q16363	1823 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GNAT2	P19087	354 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	BACH2	Q9BYV9	841 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LAMB1	P07942	1786 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SMARCAL1-208	ENST00000434435	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RHBDL3	P58872	404 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	USP40	Q9NVE5	1235 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MYO1B	O43795	1136 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SEC24B	O95487	1268 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	EPS15	P42566	896 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	VPS53	Q5VIR6	699 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SMARCAL1-208	ENST00000434435	WNT10B	O00744	389 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PRKAB2	O43741	272 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	USP5	P45974	858 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PTH1R	Q03431	593 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	APP	P05067	770 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	EGFR	P00533	1210 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FOXP2	O15409	715 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MAP4K1	Q92918	833 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ZMYM6	O95789	1325 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	TDO2	P48775	406 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	NAPB	Q9H115	298 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	ALX1	Q15699	326 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	MYH8	P13535	1937 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	FLT1	P17948	1338 aa		27.7	■■■□□ 2.03
SMARCAL1-208	ENST00000434435	EPHX2	P34913	555 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SMARCAL1-208	ENST00000434435	PICALM	Q13492	652 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SMARCAL1-208	ENST00000434435	USP26	Q9BXU7	913 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SMARCAL1-208	ENST00000434435	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SMARCAL1-208	ENST00000434435	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		27.7	■■■□□ 2.02

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