RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		22.04	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		22.03	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SRGAP3	O43295	1099 aa		22.03	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2A2	P52657	109 aa		22.03	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL15	Q16663	113 aa		22.03	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	22.03	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		22.03	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		22.03	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		22.03	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		22.02	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TNNI2	P48788	182 aa		22.02	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	22.02	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	NBPF11	Q86T75	865 aa		22.02	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		22.02	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF333	Q96JL9	665 aa		22.02	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		22.02	■■□□□ 1.12
MRPL28-203	ENST00000429738	BRCA2	P51587	3418 aa		22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	SEMA3E	O15041	775 aa		22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	GNAI2	P04899	355 aa		22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	PHKA1	P46020	1223 aa		22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	VGLL4	Q14135	290 aa		22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	22.01	■■□□□ 1.11	4e-8	■■□□□ 12.7
MRPL28-203	ENST00000429738	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	CSAD	Q9Y600	493 aa		22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		22.01	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	ADORA1	P30542	326 aa		22	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		22	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		22	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		22	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP290	O15078	2479 aa		22	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	CACNB3	P54284	484 aa		21.99	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		21.99	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC102B	Q68D86	513 aa		21.99	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM83A	Q86UY5	434 aa		21.99	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		21.99	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		21.99	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		21.99	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	21.98	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDX5	P30044	214 aa		21.98	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	OTUD5	Q96G74	571 aa		21.98	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	21.98	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		21.97	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GUL7	405 aa		21.97	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		21.97	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM10	P62072	90 aa		21.97	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	TFCP2	Q12800	502 aa		21.97	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		21.97	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	21.97	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	21.97	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	CETP	P11597	493 aa		21.96	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		21.96	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	ERO1B	Q86YB8	467 aa		21.96	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		21.96	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		21.96	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		21.96	■■□□□ 1.11
MRPL28-203	ENST00000429738	TLR2	O60603	784 aa		21.95	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	21.95	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	RASGRF1	Q13972	1273 aa		21.95	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		21.95	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	XAGE2	Q96GT9	111 aa		21.95	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	21.95	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	21.94	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF22	Q14807	665 aa		21.94	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		21.94	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	BTBD19	C9JJ37	291 aa		21.93	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	POLA2	Q14181	598 aa		21.93	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		21.93	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	21.93	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	HOOK2	Q96ED9	719 aa		21.93	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	GNRH1	P01148	92 aa		21.92	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	RLBP1	P12271	317 aa		21.92	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	SNAPC2	Q13487	334 aa		21.92	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	WRNIP1	Q96S55	665 aa		21.92	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		21.92	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	GAK	O14976	1311 aa		21.91	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	IRF6	O14896	467 aa		21.91	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PRMT2	P55345	433 aa		21.91	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIL2	Q13356	520 aa		21.91	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	SSH3	Q8TE77	659 aa		21.91	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM151A	Q8WW52	585 aa		21.91	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	21.91	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		21.9	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	21.9	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	21.9	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP8B2	P98198	1209 aa		21.9	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	21.9	■■□□□ 1.1	5e-9	■□□□□ 10.7
MRPL28-203	ENST00000429738	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		21.9	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	21.9	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	AK9	Q5TCS8	1911 aa		21.9	■■□□□ 1.1
MRPL28-203	ENST00000429738	NFIA	Q12857	509 aa		21.89	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DCAF15	Q66K64	600 aa		21.89	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		21.89	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		21.88	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PPAT	Q06203	517 aa		21.88	■■□□□ 1.09

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