RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418663.5

AC004980.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC004980.1, Length 2,667 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.1-201ENST00000418663 IFNKQ9P0W0 207 aa25.34■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 FBXO3Q9UK99 471 aa25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 CDC27P30260 824 aa25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 PHKA1P46020 1223 aa25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 BRAPQ7Z569 592 aa25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.33■■□□□ 1.65
AC004980.1-201ENST00000418663 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.33■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.32■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 SUSD4Q5VX71 490 aa25.32■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 TMC6Q7Z403 805 aa25.32■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 LRP6O75581 1613 aa25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 PTPN14Q15678 1187 aa25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 NUP98P52948 1817 aa25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 PDE8AO60658 829 aa25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 ATP6V1AP38606 617 aa25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 DDB1Q16531 1140 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 NEMFO60524 1076 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 PDE8BO95263 885 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 KRT40Q6A162 431 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 VPS37DQ86XT2 251 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 SLIT2O94813 1529 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 CLIC6Q96NY7 704 aa25.3■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 ZMYM6O95789 1325 aa25.29■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 MYH7P12883 1935 aa25.29■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 CCDC102BQ68D86 513 aa25.29■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 PDE6AP16499 860 aa25.29■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 NLRP12P59046 1061 aa25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 PTPN21Q16825 1174 aa25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 C4AP0C0L4 1744 aa25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 C4BP0C0L5 1744 aa25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 ITPK1Q13572 414 aa25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 APOA5Q6Q788 366 aa25.28■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.27■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 CMA1P23946 247 aa25.27■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 SLC39A14Q15043 492 aa25.27■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.27■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 KCNQ2O43526 872 aa25.27■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 ATP1A3P13637 1013 aa25.27■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 KCNQ4P56696 695 aa25.27■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.27■■□□□ 1.64
AC004980.1-201ENST00000418663 SYKP43405 635 aa25.26■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.26■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 AIDAQ96BJ3 306 aa25.26■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 PNOCQ13519 176 aa25.26■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 SHC4Q6S5L8 630 aa25.26■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 NCAPHQ15003 741 aa25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 SMIM5Q71RC9 77 aa25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 ZBTB43O43298 467 aa25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 SPECC1Q5M775 1068 aa25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.25■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 SIK1P57059 783 aa25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 MYH3P11055 1940 aa25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 ABCC12Q96J65 1359 aa25.24■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 GSDMDP57764 484 aa25.23■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.23■■□□□ 1.63
AC004980.1-201ENST00000418663 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms