RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPRNQ16849 979 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNNI3KQ59H18 835 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.41□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A087WZG4 1122 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STX6O43752 255 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TAF5LO75529 589 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STARD3NLO95772 234 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSF1RP07333 972 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BMP2P12643 396 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MCM5P33992 734 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXO4P98177 505 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCNH2Q12809 1159 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TCIRG1Q13488 830 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UVSSAQ2YD98 709 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATL3Q6DD88 541 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MCTP1Q6DN14 999 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DESI1Q6ICB0 168 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MEIOBQ8N635 442 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IL25Q9H293 177 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPEF2Q9C093 1822 aa6.4□□□□□ -1.38
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ELP1O95163 1332 aa6.4□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.4□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RGPD5Q99666 1765 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC27A2O14975 620 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LILRB3O75022 631 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADAM23O75077 832 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYL6BP14649 208 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AK2P54819 239 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBE2HP62256 183 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXK2Q01167 660 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBPF14Q5TI25 921 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBPF15Q8N660 670 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRR7Q8TB68 274 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDK15Q96Q40 435 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DISP2A7MBM2 1401 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C5P01031 1676 aa6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EYA2O00167 538 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGSF3O75054 1194 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CAVIN2O95810 425 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLURP2P0DP57 97 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SYT1P21579 422 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPS6KB1P23443 525 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EVCP57679 992 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTH1RQ03431 593 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHRNA2Q15822 529 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KANK3Q6NY19 840 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPT2Q8TD30 523 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms