RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 FZD1Q9UP38 647 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 NOGQ13253 232 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 ZAP70P43403 619 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM83AQ86UY5 434 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 ZIC5Q96T25 663 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 GAKO14976 1311 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 LDHCP07864 332 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 GSTO1P78417 241 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K11Q16584 847 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF384Q8TF68 577 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC10A3P09131 477 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 AIDAQ96BJ3 306 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 DCTPP1Q9H773 170 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM151AQ8WW52 585 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 BTDP43251 543 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 TCP10Q12799 353 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 NFIAQ12857 509 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXN1O15353 648 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4-204ENST00000416021 UNCXA6NJT0 531 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 IDI2Q9BXS1 227 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 IGSF3O75054 1194 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 HOOK2Q96ED9 719 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 CSRNP1Q96S65 589 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 RHBDL3P58872 404 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 ENTPD3O75355 529 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS3P49796 1198 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K9P80192 1104 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 BAG3O95817 575 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 SPRYD7Q5W111 196 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5JP18859 108 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP7A1P22680 504 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP4CP60510 307 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K12Q12852 859 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 PICALMQ13492 652 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 AAMPQ13685 434 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF15Q66K64 600 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 CA12O43570 354 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 LBX1P52954 281 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ELP3Q9H9T3 547 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLIM4O00461 696 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 TM4SF4P48230 202 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX11Q8IYF3 940 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.67■■□□□ 1.7
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