RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATG3Q9NT62 314 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 PIM2Q9P1W9 311 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 B3GALT4O96024 378 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D32Q96NH3 1257 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 CORO1BQ9BR76 489 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 ABCB6Q9NP58 842 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAD18Q9NS91 495 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARAP1Q96P48 1450 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 WNT11O96014 354 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 NFICP08651 508 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAB6AP20340 208 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADMP35318 185 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 IRAK1P51617 712 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 DYMQ7RTS9 669 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 CSRNP1Q96S65 589 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 AP4E1Q9UPM8 1137 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIF27Q86VH2 1401 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-55P-201ENST00000411092 NCAPD3P42695 1498 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 FOSL1P15407 271 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAAP100Q0VG06 881 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRM2Q14416 872 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDE3AQ14432 1141 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM105AQ9NUU6 356 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM170BA6NMN3 283 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 BTBD11A6QL63 1104 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 AOC2O75106 756 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 ASPAP45381 313 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAP7Q14244 749 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 PI16Q6UXB8 463 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZAR1Q86SH2 424 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 GATA6Q92908 595 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR18Q9BV38 432 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 TIAM1Q13009 1591 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYP26A1O43174 497 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 LIG1P18858 919 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 FCGRTP55899 365 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 AP3B2Q13367 1082 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 MSMPQ1L6U9 139 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMC7Q7Z402 723 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 FMNL2Q96PY5 1086 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 NLRP2Q9NX02 1062 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 CUX1P39880 1505 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 CFTRP13569 1480 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAX4O43316 350 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 LGR6Q9HBX8 967 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 FHAD1B1AJZ9 1412 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMPRSS2O15393 492 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 BRD1O95696 1058 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-55P-201ENST00000411092 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms