RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.43■■□□□ 1.5
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HOXD12-201ENST00000404162 DCAF15Q66K64 600 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 HOOK2Q96ED9 719 aa24.42■■□□□ 1.5
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HOXD12-201ENST00000404162 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 VPS37DQ86XT2 251 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 GABRQQ9UN88 632 aa24.41■■□□□ 1.5
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HOXD12-201ENST00000404162 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 LRCH3Q96II8 777 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 MRIQ9BWK5 157 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD12-201ENST00000404162 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.4■■□□□ 1.5
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HOXD12-201ENST00000404162 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
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HOXD12-201ENST00000404162 SGPL1O95470 568 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 BCRP11274 1271 aa24.38■■□□□ 1.49
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HOXD12-201ENST00000404162 CYP2C8P10632 490 aa24.37■■□□□ 1.49
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HOXD12-201ENST00000404162 STAP2Q9UGK3 403 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 BCAMP50895 628 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC24Q50LG9 513 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 FAM151AQ8WW52 585 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 EVI5O60447 810 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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HOXD12-201ENST00000404162 ALDH1L1O75891 902 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 TCP10Q12799 353 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC184Q52MB2 194 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD12-201ENST00000404162 METTL24Q5JXM2 366 aa24.33■■□□□ 1.49
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HOXD12-201ENST00000404162 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.28■■□□□ 1.48
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HOXD12-201ENST00000404162 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.27■■□□□ 1.48
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HOXD12-201ENST00000404162 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.26■■□□□ 1.47
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HOXD12-201ENST00000404162 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD12-201ENST00000404162 UTYO14607 1347 aa24.26■■□□□ 1.47
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HOXD12-201ENST00000404162 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD12-201ENST00000404162 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXD12-201ENST00000404162 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXD12-201ENST00000404162 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD12-201ENST00000404162 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXD12-201ENST00000404162 CAPN2P17655 700 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD12-201ENST00000404162 WDR63Q8IWG1 891 aa24.24■■□□□ 1.47
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