RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM14Q14142 442 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 SPAG5Q96R06 1193 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 GSTO1P78417 241 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 NBPF11Q86T75 865 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC8AQ8IWT6 810 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 GOPCQ9HD26 462 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 VWA3AA6NCI4 1184 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CHMP4BP1P59074 171 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 MYZAPP0CAP1 466 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 MCM7P33993 719 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CETN1Q12798 172 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.54■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 PHACTR2O75167 634 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 TAF5LO75529 589 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 HAUS7Q99871 368 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 PRM3Q9NNZ6 103 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 NAPAP54920 295 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CUL5Q93034 780 aa18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 POTEJP0CG39 1038 aa18.52■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 TNIP1Q15025 636 aa18.52■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 POSTNQ15063 836 aa18.52■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CAPZA3Q96KX2 299 aa18.52■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CLTCL1P53675 1640 aa18.52■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGA6P23229 1130 aa18.52■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.52■□□□□ 0.56
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.52■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf50Q9HD87 102 aa18.52■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa18.52■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 PHKBQ93100 1093 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 COPRSQ9NQ92 184 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 ERBB4Q15303 1308 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 PFKFB1P16118 471 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF174Q15697 407 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP2R5BQ15173 497 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 METP08581 1390 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R2P41236 205 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 EBAG9O00559 213 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 SSR1P43307 286 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 CMA1P23946 247 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC25BP30305 580 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 ZAP70P43403 619 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 VPS16Q9H269 839 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 MADDQ8WXG6 1647 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 MTX1Q13505 466 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 ADCY9O60503 1353 aa18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 VAV2P52735 878 aa18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PQ27 194 aa18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PQ64 194 aa18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PQD8 194 aa18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 A1BGP04217 495 aa18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2-201ENST00000398073 ERMNQ8TAM6 284 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms