RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPATA5Q8NB90 893 aa20.12■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 AIDAQ96BJ3 306 aa20.12■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 NFIAQ12857 509 aa20.11■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRKG1Q13976 671 aa20.11■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.11■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.1■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 AK9Q5TCS8 1911 aa20.1■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 CA12O43570 354 aa20.1■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.1■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.1■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNNI2P48788 182 aa20.09■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 MECOMQ03112 1051 aa20.09■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.09■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIPA1L1O43166 1804 aa20.09■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 GJA5P36382 358 aa20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPRYD7Q5W111 196 aa20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.816e-30■■■■□ 20.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 IDI2Q9BXS1 227 aa20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCF2Q9UG63 623 aa20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 TSKSQ9UJT2 592 aa20.08■□□□□ 0.81
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 TM4SF4P48230 202 aa20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 RHBDL3P58872 404 aa20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM151AQ8WW52 585 aa20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNF186Q9NXI6 227 aa20.07■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 GORABQ5T7V8 394 aa20.06■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.06■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.06■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 WNK4Q96J92 1243 aa20.06■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.06■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFFO2Q5TF58 517 aa20.05■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.05■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.05■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNRKQ9NRH2 765 aa20.05■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP40Q9NVE5 1235 aa20.05■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.04■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 HMMRO75330 724 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ENTPD3O75355 529 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 BTDP43251 543 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZAP70P43403 619 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGS3P49796 1198 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.03■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPRFP10586 1907 aa20.02■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 IGSF3O75054 1194 aa20.02■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP3K10Q02779 954 aa20.02■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 VGLL4Q14135 290 aa20.02■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.02■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 AACSQ86V21 672 aa20.02■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.02■□□□□ 0.8
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYH7P12883 1935 aa20.02■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 DOCK1Q14185 1865 aa20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB11FIP3O75154 756 aa20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRPA1O75762 1119 aa20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP3K9P80192 1104 aa20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCP10Q12799 353 aa20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLF2Q8IX21 1173 aa20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNS4Q8IZW8 715 aa20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.01■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATAD5Q96QE3 1844 aa19.99■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP4CP60510 307 aa19.99■□□□□ 0.79
NME1-NME2-202ENST00000393193 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms