RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 PHKBQ93100 1093 aa18.31■□□□□ 0.52
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PTPRN2-201ENST00000389413 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.31■□□□□ 0.52
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PTPRN2-201ENST00000389413 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.518e-7■■□□□ 12.5
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.26■□□□□ 0.51
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PTPRN2-201ENST00000389413 PPP2R3AQ06190 1150 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 POSTNQ15063 836 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 SPATA5Q8NB90 893 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 LRRC24Q50LG9 513 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 GPR108Q9NPR9 543 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 ALKQ9UM73 1620 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 FGAP02671 866 aa18.25■□□□□ 0.51
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