RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K9P80192 1104 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.241e-7■■□□□ 12.2
FAAP20-201ENST00000378543 SSH3Q8TE77 659 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 AK9Q5TCS8 1911 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 IFNL1Q8IU54 200 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 OPTNQ96CV9 577 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 ABCF2Q9UG63 623 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
FAAP20-201ENST00000378543 VGLL4Q14135 290 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 FAM151AQ8WW52 585 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 USP40Q9NVE5 1235 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 GPR25O00155 361 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 NFIAQ12857 509 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 GORABQ5T7V8 394 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 HMG20BQ9P0W2 317 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 ALDH1A1P00352 501 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 TCP10Q12799 353 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 PANK1Q8TE04 598 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 GAKO14976 1311 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 HOOK2Q96ED9 719 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 CSADQ9Y600 493 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 PI16Q6UXB8 463 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 WRNIP1Q96S55 665 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 MIGA2Q7L4E1 593 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 GPR108Q9NPR9 543 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-201ENST00000378543 DCAF15Q66K64 600 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 SPATA5Q8NB90 893 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 PTPN18Q99952 460 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 MCAMP43121 646 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 TNNI3KQ59H18 835 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF384Q8TF68 577 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 OTUD5Q96G74 571 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 FKTNO75072 461 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 MECOMQ03112 1051 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 CEP85Q6P2H3 762 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 SLF2Q8IX21 1173 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 IDI2Q9BXS1 227 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 INPP5BP32019 993 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 BTDP43251 543 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 RGS3P49796 1198 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 BRI3BPQ8WY22 251 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 DOCK2Q92608 1830 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 ERO1BQ86YB8 467 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 ENTPD3O75355 529 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 GTF2A2P52657 109 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 CRHR2Q13324 411 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 PDE3AQ14432 1141 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 CCL15Q16663 113 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF112Q9UJU3 913 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-201ENST00000378543 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 SNRKQ9NRH2 765 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 RAI14Q9P0K7 980 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 RHBDL3P58872 404 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 IRF6O14896 467 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-201ENST00000378543 LDHCP07864 332 aa28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms