RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365289.1

RNU6-742P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 742, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-742P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-742P-201ENST00000365289 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZNF536O15090 1300 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 N4BP3O15049 544 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 PLSCR1O15162 318 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 HOXA2O43364 376 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 AOC2O75106 756 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 TADA3O75528 432 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 TATP17735 454 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 PLA2G4AP47712 749 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SMTNP53814 917 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 GJA9P57773 515 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 PDE3BQ13370 1112 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 PERM1Q5SV97 790 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 CYP2U1Q7Z449 544 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 FAM129CQ86XR2 697 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 GALNT11Q8NCW6 608 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 DBF4BQ8NFT6 615 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 PRR7Q8TB68 274 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ADAMTS15Q8TE58 950 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 RHBDD1Q8TEB9 315 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 MYLIPQ8WY64 445 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 TTPALQ9BTX7 342 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 MUC3BQ9H195 1237 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 FFAR3O14843 346 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SPRY2O43597 315 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 TAF6P49848 677 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SELENOPP49908 381 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 PTH1RQ03431 593 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 PTGDRQ13258 359 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ICAM4Q14773 271 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 NRN1LQ496H8 165 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 LYPD8Q6UX82 237 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 LIMS2Q7Z4I7 341 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 TMPRSS12Q86WS5 348 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SPATA25Q9BR10 227 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SIRT5Q9NXA8 310 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 KCNK4Q9NYG8 393 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 PDE6BP35913 854 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 MCAMP43121 646 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZNF81P51508 661 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 EPHB3P54753 998 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 MAP7Q14244 749 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SLC44A4Q53GD3 710 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 USPL1Q5W0Q7 1092 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 CDPF1Q6NVV7 123 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 LRFN4Q6PJG9 635 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 BICDL1Q6ZP65 573 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 RNF207Q6ZRF8 634 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZBTB33Q86T24 672 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 KRT78Q8N1N4 520 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 UBASH3BQ8TF42 649 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 LRRN4Q8WUT4 740 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZNF414Q96IQ9 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 WACQ9BTA9 647 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 SNX11Q9Y5W9 270 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-742P-201ENST00000365289 CCDC187A0A096LP49 1063 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 NOBOXO60393 691 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 FSTL1Q12841 308 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 STRIP1Q5VSL9 837 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 TMEFF1Q8IYR6 380 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 C1orf127Q8N9H9 656 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 NLRP7Q8WX94 980 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 ARXQ96QS3 562 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 EFCC1Q9HA90 598 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 MKNK2Q9HBH9 465 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 CD248Q9HCU0 757 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 NEUROD4Q9HD90 331 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 PPME1Q9Y570 386 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 ZAR1LA6NP61 321 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 TM4SF5O14894 197 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 FOXN1O15353 648 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 BMP15O95972 392 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 LMNAP02545 664 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 CEACAM5P06731 702 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-742P-201ENST00000365289 MAKP20794 623 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms