RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 PTCH1Q13635 1447 aa18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 CHUKO15111 745 aa18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 IFT88Q13099 833 aa18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 KANK3Q6NY19 840 aa18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 KIF5AQ12840 1032 aa18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 SNCBQ16143 134 aa18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 TET3O43151 1660 aa18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 SATB1Q01826 763 aa18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 KCTD16Q68DU8 428 aa18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PACS1-201ENST00000320580 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 KCNA6P17658 529 aa18.77■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 KRT83P78385 493 aa18.77■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 RESTQ13127 1097 aa18.77■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 TACC1O75410 805 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 VPS16Q9H269 839 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 CLTCL1P53675 1640 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 FUT8Q9BYC5 575 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 AKR1B10O60218 316 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 MYL6BP14649 208 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.76■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 MARCH6O60337 910 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 KRT9P35527 623 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 VSTM4Q8IW00 320 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 H3BQF6 201 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 CUTAO60888 179 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD24Q8TF21 1146 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 WASF1Q92558 559 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.75■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 IL13P35225 146 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 PSMB7Q99436 277 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 E9PCH4 1651 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ZNF827Q17R98 1081 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 FOXR1Q6PIV2 292 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 IQCA1Q86XH1 822 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 GOPCQ9HD26 462 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 DIP2BQ9P265 1576 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 EPS15P42566 896 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 UBXN1Q04323 297 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ANKS4BQ8N8V4 417 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 SOWAHDA6NJG2 315 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ENC1O14682 589 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 SASH3O75995 380 aa18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 CEP152O94986 1710 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 A0A0D9SFI3 127 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 SPAG1Q07617 926 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 DONSONQ9NYP3 566 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ABCA6Q8N139 1617 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 KIF5BP33176 963 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 CLIC4Q9Y696 253 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 ZNF213O14771 459 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 IKBKBO14920 756 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 MYSM1Q5VVJ2 828 aa18.73■□□□□ 0.59
PACS1-201ENST00000320580 AIDAQ96BJ3 306 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms