RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 TMEM87BQ96K49 555 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 DACH1Q9UI36 760 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ATRNO75882 1429 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PAPPAQ13219 1627 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 FOXP2O15409 715 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 IGSF3O75054 1194 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 VPS37DQ86XT2 251 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 MPHOSPH8Q99549 860 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 EFCAB8A8MWE9 144 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 KRT40Q6A162 431 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 WASF1Q92558 559 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 CHD4Q14839 1912 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 CLCN6P51797 869 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PTPAQ15257 358 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ZNF446Q9NWS9 450 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 SHC4Q6S5L8 630 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 STK36Q9NRP7 1315 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 DCCP43146 1447 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ATP1A3P13637 1013 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ADORA1P30542 326 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ZAP70P43403 619 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TEX35Q5T0J7 233 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 CNNM3Q8NE01 707 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 NPHP1O15259 732 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ZBTB43O43298 467 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TCIRG1Q13488 830 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 PNOCQ13519 176 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 APOA5Q6Q788 366 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 MAP3K14Q99558 947 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 STX10O60499 249 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 TADA3O75528 432 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 ADD2P35612 726 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 UBE3CQ15386 1083 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 REXO1L1PQ8IX06 675 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.9■□□□□ 0.14
MKS1-201ENST00000313863 A1BGP04217 495 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 CASQ1P31415 396 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 ISM2Q6H9L7 571 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 KANK3Q6NY19 840 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 MLKLQ8NB16 471 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 MYH3P11055 1940 aa15.89■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 CSF1RP07333 972 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 DPF2Q92785 391 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 FANCLQ9NW38 375 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 ATF3P18847 181 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 LIFRP42702 1097 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 ALX1Q15699 326 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.88■□□□□ 0.13
MKS1-201ENST00000313863 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms