RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.77■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 TEX33O43247 280 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 MCTP2Q6DN12 878 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABTB2Q8N961 1025 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNH3Q9ULD8 1083 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF28PB7ZC32 967 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 SRGAP2O75044 1071 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEP57Q86XR8 500 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATG3Q9NT62 314 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 POTEB2H3BUK9 544 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 INPP5BP32019 993 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CORO7P57737 925 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM71BQ8TC56 605 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYL10Q9BUA6 226 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 ALDH1L1O75891 902 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBL2Q08999 1139 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMB7Q99436 277 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRC1O43663 620 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPFIA4O75335 1185 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 TDO2P48775 406 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP32Q8NFA0 1604 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CASP1P29466 404 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDC27P30260 824 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 TC2NQ8N9U0 490 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM76AQ8TAV0 307 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNB2Q92953 911 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PQ27 194 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PQ64 194 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PQD8 194 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CMA1P23946 247 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP1A2P50993 1020 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 STIM1Q13586 685 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 KSR2Q6VAB6 950 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS16Q9H269 839 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 HDAC6Q9UBN7 1215 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 IKBKBO14920 756 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CASP14P31944 242 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 GBP6Q6ZN66 633 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 L1RE1Q9UN81 338 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 TFR2Q9UP52 801 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABL1P00519 1130 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 FDPSP14324 419 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP6V1AP38606 617 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 JADE2Q9NQC1 790 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSD3Q9NYI0 1048 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDE6BP35913 854 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC39A6Q13433 755 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 N4BP3O15049 544 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDC25AP30304 524 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP8P40818 1118 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS37DQ86XT2 251 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 YEATS4O95619 227 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 GNGT1P63211 74 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 24.2
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCTD16Q68DU8 428 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATL3Q6DD88 541 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 YY1AP1Q9H869 796 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDUFAB1O14561 156 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 GGCXP38435 758 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIP4K2BP78356 416 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNNI3KQ59H18 835 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIFC2Q96AC6 838 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTPRMP28827 1452 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP2K7O14733 419 aa16.71■□□□□ 0.27
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