RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293349.10

PLEKHH3-201, Transcript of pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PLEKHH3, Length 2,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHH3-201ENST00000293349 TMEM232C9JQI7 657 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 KRT222Q8N1A0 295 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 FANCCQ00597 558 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 GRIN1Q05586 938 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 SHC4Q6S5L8 630 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 AIDAQ96BJ3 306 aa23.4■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 MST1RQ04912 1400 aa23.39■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 PRKAB2O43741 272 aa23.39■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 GUCY1A2P33402 732 aa23.39■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.39■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.39■■□□□ 1.34
PLEKHH3-201ENST00000293349 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.39■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 APOA5Q6Q788 366 aa23.39■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.335e-7■■■■□ 21
PLEKHH3-201ENST00000293349 ARMT1Q9H993 441 aa23.39■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 A0A1W2PQ27 194 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 A0A1W2PQ64 194 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 A0A1W2PQD8 194 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 YEATS4O95619 227 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 CAPN2P17655 700 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 SMIM22K7EJ46 135 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 NLRP12P59046 1061 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 NCAPHQ15003 741 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 LONRF3Q496Y0 759 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 PIGBQ92521 554 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZBTB43O43298 467 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ATL3Q6DD88 541 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 PDE6AP16499 860 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ADD2P35612 726 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 UBASH3AP57075 661 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 CCDC102BQ68D86 513 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 BRAPQ7Z569 592 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 DNAI1Q9UI46 699 aa23.37■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 BTBD18B2RXH4 712 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 FANCLQ9NW38 375 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 NEMFO60524 1076 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 MBD4O95243 580 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 TRIM29Q14134 588 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 CERS3Q8IU89 383 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 KLHL34Q8N239 644 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 TPM4P67936 248 aa23.35■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLC39A14Q15043 492 aa23.35■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 SYCP1Q15431 976 aa23.35■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 CNNM3Q8NE01 707 aa23.35■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.35■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 CMA1P23946 247 aa23.35■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.35■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 EPC1Q9H2F5 836 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 GSDMDP57764 484 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 PDE4BQ07343 736 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 NAPBQ9H115 298 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 EVCP57679 992 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 NR5A1Q13285 461 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 NLRP10Q86W26 655 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.34■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZMYM6O95789 1325 aa23.33■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 BRINP3Q76B58 766 aa23.33■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.33■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.33■■□□□ 1.33
PLEKHH3-201ENST00000293349 COBLO75128 1261 aa23.33■■□□□ 1.32
PLEKHH3-201ENST00000293349 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PLEKHH3-201ENST00000293349 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms