RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 LY9Q9HBG7 655 aa22.38■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 CAMTA2O94983 1202 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 DYNC1I1O14576 645 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 NTRK3Q16288 839 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 ANO1Q5XXA6 986 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 LCORLQ8N3X6 602 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 NAPBQ9H115 298 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A1W2PQ27 194 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A1W2PQ64 194 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A1W2PQD8 194 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.36■■□□□ 1.17
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LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 KRT40Q6A162 431 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 BRAPQ7Z569 592 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 BIN1O00499 593 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 YEATS4O95619 227 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 SIK1P57059 783 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 MAP3K12Q12852 859 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 DDB1Q16531 1140 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 VPS37DQ86XT2 251 aa22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 COL4A1P02462 1669 aa22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 SMIM22K7EJ46 135 aa22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 ZBTB43O43298 467 aa22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 CAVIN2O95810 425 aa22.35■■□□□ 1.17
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LPCAT3-201ENST00000261407 ANO10Q9NW15 660 aa22.35■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF202O95125 648 aa22.34■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 ISM2Q6H9L7 571 aa22.34■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 SMIM5Q71RC9 77 aa22.34■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.34■■□□□ 1.17
LPCAT3-201ENST00000261407 LRP5O75197 1615 aa22.34■■□□□ 1.17
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LPCAT3-201ENST00000261407 SARM1Q6SZW1 724 aa22.33■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.33■■□□□ 1.16
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LPCAT3-201ENST00000261407 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.33■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 TOMM22Q9NS69 142 aa22.33■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 ALX1Q15699 326 aa22.32■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.32■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.32■■□□□ 1.16
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LPCAT3-201ENST00000261407 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.32■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.32■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC39A14Q15043 492 aa22.31■■□□□ 1.16
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LPCAT3-201ENST00000261407 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 AK7Q96M32 723 aa22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 TDO2P48775 406 aa22.3■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.3■■□□□ 1.16
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LPCAT3-201ENST00000261407 CDKL5O76039 1030 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 CDC25BP30305 580 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 PTPAQ15257 358 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 SHC4Q6S5L8 630 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 MAP3K14Q99558 947 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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