RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 SRGAP3O43295 1099 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 SP3Q02447 781 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC102BQ68D86 513 aa26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.12■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 TIMM10P62072 90 aa26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 MTX1Q13505 466 aa26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 USP40Q9NVE5 1235 aa26.11■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 CETPP11597 493 aa26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 ADORA1P30542 326 aa26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.1■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM27P14373 513 aa26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 TCP10Q12799 353 aa26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 EFCC1Q9HA90 598 aa26.09■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 AK9Q5TCS8 1911 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 BCAR3O75815 825 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 GNAI2P04899 355 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 PPIL2Q13356 520 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 SNAPC2Q13487 334 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF6Q15052 776 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1B0GUL7 405 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 PPATQ06203 517 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 TFCP2Q12800 502 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 NFIAQ12857 509 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 SLF2Q8IX21 1173 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 XAGE2Q96GT9 111 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.06■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 IRF6O14896 467 aa26.06■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 ABCF2Q9UG63 623 aa26.06■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.06■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 RASGRF1Q13972 1273 aa26.05■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.05■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.05■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 INPP5BP32019 993 aa26.04■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.04■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 IDI2Q9BXS1 227 aa26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 GAKO14976 1311 aa26.03■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 BTBD19C9JJ37 291 aa26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 ENTPD3O75355 529 aa26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 GORABQ5T7V8 394 aa26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 TNNQ9UQP3 1299 aa26.02■■□□□ 1.76
NEDD8-201ENST00000250495 TLR2O60603 784 aa26.01■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.01■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.01■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 RGS3P49796 1198 aa26■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 KIF22Q14807 665 aa25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.99■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 CAP1Q01518 475 aa25.98■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 ARMC5Q96C12 935 aa25.98■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 LDHCP07864 332 aa25.97■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 BTDP43251 543 aa25.97■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.97■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.97■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 GSTO1P78417 241 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 MECOMQ03112 1051 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 NBPF11Q86T75 865 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA5Q8NB90 893 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD8-201ENST00000250495 CXCL11O14625 94 aa25.95■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 GNRH1P01148 92 aa25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 MAP3K10Q02779 954 aa25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 MIER1Q8N108 512 aa25.94■■□□□ 1.74
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