RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227451.3

DTX4-201, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DTX4, Length 5,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-201ENST00000227451 TMX1Q9H3N1 280 aa23.39■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 PPP1R2P41236 205 aa23.39■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.38■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.38■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 KDRP35968 1356 aa23.38■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.38■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 TNFAIP1Q13829 316 aa23.38■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ATP2B4P23634 1241 aa23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 SLC1A4P43007 532 aa23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 C8orf34Q49A92 452 aa23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 SPECC1Q5M775 1068 aa23.37■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.36■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.36■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 CEP83Q9Y592 693 aa23.36■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.36■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 GNG11P61952 73 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 TEKT1Q969V4 418 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 FSD2A1L4K1 749 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 NEK11Q8NG66 645 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 NOD1Q9Y239 953 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ZNF174Q15697 407 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ZAP70P43403 619 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 SMTNP53814 917 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 SHTN1A0MZ66 631 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ZNF354CQ86Y25 554 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 CNKSR1Q969H4 720 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 BCS1LQ9Y276 419 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ELP1O95163 1332 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 ADCY7P51828 1080 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.34■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 METP08581 1390 aa23.33■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 PRDM1O75626 825 aa23.33■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 MSL1Q68DK7 614 aa23.33■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.33■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 TCP10Q12799 353 aa23.33■■□□□ 1.33
DTX4-201ENST00000227451 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.33■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 KRT83P78385 493 aa23.33■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.33■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.33■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.33■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 GTF2IP78347 998 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 IL17REQ8NFR9 667 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 USP40Q9NVE5 1235 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 ATP5JP18859 108 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 SIK1P57059 783 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 IFT74Q96LB3 600 aa23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 TACC1O75410 805 aa23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 STAMBPO95630 424 aa23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 KDM5CP41229 1560 aa23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 SGSM2O43147 1006 aa23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 TAF12Q16514 161 aa23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 FAM227BQ96M60 508 aa23.31■■□□□ 1.32
DTX4-201ENST00000227451 PLIN2Q99541 437 aa23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms