RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNNQ9UQP3 1299 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTFR1Q15390 333 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRIK5Q16478 980 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VPS37DQ86XT2 251 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SHISA4Q96DD7 197 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPIL2Q13356 520 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TEKT1Q969V4 418 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOOK2Q96ED9 719 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SRRDQ9UH36 339 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CPA4Q9UI42 421 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOXD10P28358 340 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PSMC4P43686 418 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RAET1EQ8TD07 263 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MEIS3Q99687 375 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DCAF15Q66K64 600 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C17orf99Q6UX52 265 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM83AQ86UY5 434 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM47Q96LD4 638 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTGFP29279 349 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRK4P32298 578 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GNAI3P08754 354 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OSBPP22059 807 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPATQ06203 517 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDHXO00330 501 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GJA8P48165 433 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYPNQ86TC9 1320 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GJB1P08034 283 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCL5P13501 91 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 INPP5BP32019 993 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF208Q9H0X6 261 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SZT2Q5T011 3432 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRIQ9BWK5 157 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAST3O60307 1309 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBXN2AP68543 259 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 METTL24Q5JXM2 366 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRC24Q50LG9 513 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BCAMP50895 628 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GNAI2P04899 355 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RLBP1P12271 317 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FCGRTP55899 365 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRKCZQ05513 592 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRO3102Q9H379 93 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EYA2O00167 538 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DLL1O00548 723 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDE8BO95263 885 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MS4A1P11836 297 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM151AQ8WW52 585 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCP10Q12799 353 aa23.43■■□□□ 1.34
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