RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202868.3

Ctbp1-211, Transcript of C-terminal-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctbp1, Length 2,436 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Hps6Q8BLY7 805 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 CrcpO35427 148 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 SowahdQ8BY98 327 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 NenfQ9CQ45 171 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Stag1Q9D3E6 1258 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Stxbp4Q9WV89 557 aa27.36■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Znf496Q5SXI5 585 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Pcdhb14Q6PB90 796 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 9230110C19RikQ8CC70 267 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Sox30Q8CGW4 782 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Gnat2P50149 354 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Dnaaf4Q8R368 420 aa27.35■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Cd3dP04235 173 aa27.34■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Slc39a11Q8BWY7 342 aa27.34■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Fer1l6E0CZ42 1862 aa27.34■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Pknox2Q8BG99 474 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Olfm5Q8BU90 496 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Trip6Q9Z1Y4 480 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Slc4a4O88343 1079 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 MsnP26041 577 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Fam170aQ66LM6 333 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 CerkQ8K4Q7 531 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Suclg2Q9Z2I8 433 aa27.33■■□□□ 1.97
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Rtkn2Q14B46 604 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Pm20d1Q8C165 503 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 1700029H14RikE9PY36 240 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Pold4Q9CWP8 107 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Cnpy3Q9DAU1 276 aa27.32■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Bin1O08539 588 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Trim30aP15533 496 aa27.31■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Snai1Q02085 264 aa27.31■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Tmem87aQ8BXN9 555 aa27.31■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Q3TYL0 343 aa27.31■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Nxf2Q4ZGD8 691 aa27.31■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Gpatch11Q3UFS4 262 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Klc3Q91W40 508 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Filip1Q9CS72 1211 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Large1Q9Z1M7 756 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 CebpaP53566 359 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Irf5P56477 497 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Ehd2Q8BH64 543 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Rec8Q8C5S7 591 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Ankrd1Q9CR42 319 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa27.3■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Plch1Q4KWH5 1682 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Ube4aE9Q735 1028 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Mtx1P47802 317 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Siah1aP61092 282 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Grin2dQ03391 1323 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Dennd3A2RT67 1274 aa27.28■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Vps33bP59016 617 aa27.28■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Arhgef16Q3U5C8 713 aa27.28■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Zbtb21E9Q444 1094 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Anks1aP59672 1150 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Rtn1Q8K0T0 780 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Evc2Q8K1G2 1220 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Wasf1Q8R5H6 559 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 WtapQ9ER69 396 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Cyp24a1Q64441 514 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Haus7Q8BKT8 364 aa27.27■■□□□ 1.96
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Zscan29E9Q5B4 869 aa27.26■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Terb1Q8C0V1 768 aa27.26■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Glis3Q6XP49 780 aa27.26■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Sass6Q80UK7 654 aa27.26■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa27.26■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa27.25■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Pde11aP0C1Q2 933 aa27.25■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Prl2c1Q5SVL9 228 aa27.25■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Rnf41Q8BH75 317 aa27.25■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Popdc2Q9ES82 367 aa27.25■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Vnn1Q9Z0K8 512 aa27.25■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Atp8b5A3FIN4 1183 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Npy5rO70342 466 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Slc7a3P70423 618 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Gas2l3Q3UWW6 683 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 MbipQ99LQ1 341 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Ccdc94Q9D6J3 314 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Dapk3O54784 448 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Kcnd1Q03719 651 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Usp13Q5BKP2 858 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Q8K2W9 541 aa27.24■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Ampd3O08739 766 aa27.23■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Prl7d1P04769 244 aa27.23■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Ms4a1P19437 291 aa27.23■■□□□ 1.95
Ctbp1-211ENSMUST00000202868 Stat5bP42232 786 aa27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.8 ms