RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem143Q8VD26 458 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FliiQ9JJ28 1271 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc4a4O88343 1079 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifit1bl2Q3U687 466 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp251Q6PCX8 632 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ginm1Q91WR6 327 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Frmd7A2AD83 703 aa30.31■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slitrk3Q810B9 980 aa30.31■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Card6E9PWH2 1175 aa30.31■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gys2Q8VCB3 704 aa30.3■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cfap44E9Q5M6 1843 aa30.3■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Foxp1P58462 705 aa30.3■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc44a1Q6X893 653 aa30.3■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnaaf4Q8R368 420 aa30.3■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 U2af2P26369 475 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd23Q812A3 306 aa30.29■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kndc1Q0KK55 1742 aa30.29■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grin2dQ03391 1323 aa30.29■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf496Q5SXI5 585 aa30.29■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnj14Q8JZN3 434 aa30.29■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NenfQ9CQ45 171 aa30.29■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa30.28■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Glis3Q6XP49 780 aa30.28■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Frmd3Q8BHD4 595 aa30.28■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vnn1Q9Z0K8 512 aa30.28■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MbipQ99LQ1 341 aa30.28■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FAM186AQ9D9R9 1790 aa30.28■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prl2c1Q5SVL9 228 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep135Q6P5D4 1140 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Haus7Q8BKT8 364 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hps6Q8BLY7 805 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Efcc1Q9JJF6 558 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trip6Q9Z1Y4 480 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Frat1P70339 274 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gimap5Q8BWF2 308 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc39a11Q8BWY7 342 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc94Q9D6J3 314 aa30.27■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnni2P13412 182 aa30.26■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Larp6Q8BN59 492 aa30.26■■■□□ 2.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtx1P47802 317 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Anks1aP59672 1150 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cnnm2Q3TWN3 875 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IqcgQ80W32 419 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mast2Q60592 1734 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dapk3O54784 448 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GabrdP22933 449 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cnpy3Q9DAU1 276 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ckap2Q3V1H1 664 aa30.25■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep120Q7TSG1 988 aa30.25■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd3dP04235 173 aa30.25■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf653Q6YND2 615 aa30.25■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 WtapQ9ER69 396 aa30.25■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ces1hD3Z298 562 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp13Q5BKP2 858 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 VmacQ8BP01 174 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfm5Q8BU90 496 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lekr1B2RVN1 116 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rtn1Q8K0T0 780 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stag1Q9D3E6 1258 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef16Q3U5C8 713 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem87aQ8BXN9 555 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Filip1Q9CS72 1211 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lama4P97927 1816 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myh3P13541 1940 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf568E9PYI1 671 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grin1P35438 938 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Siah1aP61092 282 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd1Q9CR42 319 aa30.23■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 1700029H14RikE9PY36 240 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LtkP08923 888 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf526Q8BI66 675 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Etnk1Q9D4V0 363 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Casz1Q9CWL2 1761 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Casp1P29452 402 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp24a1Q64441 514 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Otop3Q80UF9 577 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa30.22■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dennd3A2RT67 1274 aa30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp8b5A3FIN4 1183 aa30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc1a4O35874 532 aa30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc12Q8BW49 704 aa30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde11aP0C1Q2 933 aa30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam13bQ8K2H3 851 aa30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Paf1Q8K2T8 535 aa30.21■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa30.2■■■□□ 2.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gnat2P50149 354 aa30.2■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q3TYL0 343 aa30.2■■■□□ 2.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sept9Q80UG5 583 aa30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 165.7 ms