RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.98□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 LPAR2Q9HBW0 351 aa9.98□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.98□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 CNIH1O95406 144 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 NUP37Q8NFH4 326 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 OR8B2Q96RD0 313 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 Q9H3A6 140 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 HYPMO75409 117 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 ESDP10768 282 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.97□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV3-23P01764 117 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 PSG1P11464 419 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 STPG4Q8N801 248 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 PERPQ96FX8 193 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 CHODLQ9H9P2 273 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.96□□□□□ -0.81
SPIN3-232ENST00000639956 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.96□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 FSTL3O95633 263 aa9.96□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 GTSF1Q8WW33 167 aa9.96□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM133Q9H2Q1 129 aa9.96□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.96□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 P01737 135 aa9.96□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 PRRX1P54821 245 aa9.96□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 SSX8Q7RTT4 187 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 PNKDQ8N490 385 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 Q8NA96 180 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 MBD6Q96DN6 1003 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 COL8A1P27658 744 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 ARF6P62330 175 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 HES1Q14469 280 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 RPEQ96AT9 228 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.95□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 ZFHX3Q15911 3703 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 SHISA9B4DS77 424 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 KLRD1Q13241 179 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 GPR82Q96P67 336 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 SPG11Q96JI7 2443 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 M0R3E3 92 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 IGLC2P0DOY2 106 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 IGLC3P0DOY3 106 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.94□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 DLEU1O43261 78 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 TCF21O43680 179 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 FOXC1Q12948 553 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 FBLN7Q53RD9 439 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 hDV102S1A0JD36 115 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 TCRAP04437 139 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 DLX6P56179 175 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 FXYD7P58549 80 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 MC5RP33032 325 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 THAP8Q8NA92 274 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.93□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 VSTM5A8MXK1 200 aa9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 CHEK1O14757 476 aa9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 SNAI2O43623 268 aa9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 IGLL1P15814 213 aa9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 CTRLP40313 264 aa9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 TIMM23O14925 209 aa9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 GP9P14770 177 aa9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 HBBP68871 147 aa9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SPIN3-232ENST00000639956 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms