RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635893.1

SCN1A-211, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene SCN1A, Length 168 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-211ENST00000635893 OR2J2O76002 312 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 IFNA10P01566 189 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 CASP1P29466 404 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 PCTPQ9UKL6 214 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 PCNX1Q96RV3 2341 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 SPTBN2O15020 2390 aa-1.23□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 TMEM213A2RRL7 107 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 GPR31O00270 319 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 COX7CP15954 63 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 LPCAT3Q6P1A2 487 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 OR51D1Q8NGF3 324 aa-1.24□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 UCHL3P15374 230 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 S100A4P26447 101 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 DEFA1P59665 94 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 NAA20P61599 178 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 PMAIP1Q13794 54 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 AADACL4Q5VUY2 407 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ARL17AQ8IVW1 177 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 SYCE1Q8N0S2 351 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 WFDC5Q8TCV5 224 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 SLAMF6Q96DU3 332 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 KIFC1Q9BW19 673 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 MYO7AQ13402 2215 aa-1.25□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ECM29Q5VYK3 1845 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ODAMA1E959 279 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 B4DSR2 109 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 FXYD1O00168 92 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 PFDN6O15212 129 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 SPRR2EP22531 72 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 OCIAD2Q56VL3 154 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 CLVS2Q5SYC1 327 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 SFXN4Q6P4A7 337 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 FAM213BQ8TBF2 198 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 C3orf18Q9UK00 162 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 OR52A1Q9UKL2 312 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 HECW1Q76N89 1606 aa-1.26□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 A0A1B0GV50 99 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 SSNA1O43805 119 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 HLA-DRB1P01911 266 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 DYNLT1P63172 113 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 KLK9Q2XQG4 91 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 C4orf22Q6V702 233 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 GDPD1Q8N9F7 314 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H2BLQ99880 126 aa-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 TEX15Q9BXT5 2789 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 C2CD3Q4AC94 2353 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 A0A087X0T9 212 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 FABP12A6NFH5 140 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ERC2-IT1O76042 136 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 S100A9P06702 114 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 ROMO1P60602 79 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 VMO1Q7Z5L0 202 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 OR52A5Q9H2C5 316 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 OR51I1Q9H343 314 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 TREM1Q9NP99 234 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 CHMP5Q9NZZ3 219 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 OPTCQ9UBM4 332 aa-1.28□□□□□ -2.61
SCN1A-211ENST00000635893 PTPRFP10586 1907 aa-1.28□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 BCORL1Q5H9F3 1711 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 C1orf196B1AJZ1 125 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 E7EUB6 86 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 TIMM17BO60830 172 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 CXCL8P10145 99 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 SPRR2AP35326 72 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 BLVRAP53004 296 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 OR5D14Q8NGL3 314 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 CANT1Q8WVQ1 401 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 MUCL1Q96DR8 90 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 PRADC1Q9BSG0 188 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 GGACTQ9BVM4 153 aa-1.29□□□□□ -2.62
SCN1A-211ENST00000635893 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa-1.29□□□□□ -2.62
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