RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ZNF137PP52743 207 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 Q6AWC8 147 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 HIGD1BQ9P298 99 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 HLA-DRB4P13762 266 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 CD46P15529 392 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 S100A7P31151 101 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 TNFRSF14Q92956 283 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.89□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 SHISA9B4DS77 424 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 H3BUT2 72 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 RIGQ13278 110 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 HARBI1Q96MB7 349 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 ZMAT4Q9H898 229 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 A1L4Q6 167 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PSMG4Q5JS54 123 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 LINC00311Q8N616 119 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 TMEM186Q96B77 213 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.88□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 APOA2P02652 100 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 GUCD1Q96NT3 240 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PPI3 338 aa7.87□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 KLK10O43240 276 aa7.87□□□□□ -1.15
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HCG18-242ENST00000602319 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.87□□□□□ -1.15
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HCG18-242ENST00000602319 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.86□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 DOCK7Q96N67 2140 aa7.86□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PLAUP00749 431 aa7.86□□□□□ -1.15
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HCG18-242ENST00000602319 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.86□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PATE3B3GLJ2 98 aa7.86□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 CFIP05156 583 aa7.86□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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HCG18-242ENST00000602319 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
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HCG18-242ENST00000602319 SPATA25Q9BR10 227 aa7.85□□□□□ -1.15
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HCG18-242ENST00000602319 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.85□□□□□ -1.15
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HCG18-242ENST00000602319 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.85□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 C18orf15Q96N68 181 aa7.85□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 RND1Q92730 232 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 THYN1Q9P016 225 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 CACNA1DQ01668 2161 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 hADV38S2A0JD32 116 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 H0Y8G0 127 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 FCN3O75636 299 aa7.84□□□□□ -1.15
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