RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
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CCNDBP1-211ENST00000567434 H2AFB2P0C5Z0 115 aa12.51□□□□□ -0.41
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MEOX2P50222 304 aa12.51□□□□□ -0.41
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CCNDBP1-211ENST00000567434 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.47□□□□□ -0.41
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MIFP14174 115 aa12.45□□□□□ -0.42
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF546Q86UE3 836 aa12.45□□□□□ -0.42
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CCNDBP1-211ENST00000567434 H3BRN7 92 aa12.44□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.44□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00052Q96N35 136 aa12.44□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa12.44□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAF2O60831 178 aa12.43□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q8NAQ8 132 aa12.43□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.43□□□□□ -0.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 C16orf92Q96LL3 132 aa12.43□□□□□ -0.42
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