RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559373.1

TSPAN3-206, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN3, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-206ENST00000559373 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF709Q8N972 641 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 TRGV9Q99603 122 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 RNF126Q9BV68 326 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC25A22Q9H936 323 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 CCDC160A6NGH7 325 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 M0R2N4 97 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 PSMB3P49720 205 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 SFT2D2O95562 160 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 FAM78BQ5VT40 261 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 THAP8Q8NA92 274 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 SYNGR2O43760 224 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 PRM2P04554 102 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 FABP1P07148 127 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 ORM2P19652 201 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 C16orf92Q96LL3 132 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 C17orf77Q96MU5 243 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 RSG1Q9BU20 258 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN3-206ENST00000559373 PRSS46E5RG02 174 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 MED6O75586 246 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 AMBPP02760 352 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 HTN3P15516 51 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 AP3S2P59780 193 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 LRTM2Q8N967 370 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 DOK5Q9P104 306 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 ADAP1O75689 374 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 PSG9Q00887 426 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 NEU1Q99519 415 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 A0A0J9YX75 114 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 ZNF98A6NK75 572 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 ISLRO14498 428 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC25A6P12236 298 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 AKR1C1Q04828 323 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 FGL1Q08830 312 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 RFNGQ9Y644 331 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 CCNKO75909 580 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 S100A5P33763 92 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 RNF182Q8N6D2 247 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 RPRMQ9NS64 109 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 DKK2Q9UBU2 259 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 SMCO3A2RU48 225 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 GALR1P47211 349 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 CCDC190Q86UF4 302 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 P0DMU3 169 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 FAM231AP0DMU4 169 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 FAM231CP0DMU5 169 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 PAX9P55771 341 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 MUC4Q99102 2169 aa14.58□□□□□ -0.07
TSPAN3-206ENST00000559373 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 C9orf170A2RU37 121 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 TMEM189A5PLL7 270 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 M0R2Z0 102 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 HBE1P02100 147 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 PSENENQ9NZ42 101 aa14.58□□□□□ -0.08
TSPAN3-206ENST00000559373 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms