RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 OBSL1O75147 1896 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV4-59P01825 116 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 RASL11AQ6T310 242 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 OR11H2Q8NH07 326 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM160Q9NX00 188 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 NMSQ5H8A3 153 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 RARRES2Q99969 163 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 HBBP68871 147 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 RAB37Q96AX2 223 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 PSG8Q9UQ74 426 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 ATP5G3P48201 142 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 CDK2AP2O75956 126 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 AJUBAQ96IF1 538 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-209ENST00000550857 EPDR1Q9UM22 224 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 FCN3O75636 299 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 RHOHQ15669 191 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf52A6NGY3 159 aa6.47□□□□□ -1.37
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