RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 RNF2Q99496 336 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TUBA4BQ9H853 241 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 PSENENQ9NZ42 101 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 OR11H12B2RN74 326 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SSSCA1O60232 199 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SCGB2A1O75556 95 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 NPPCP23582 126 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TFPI2P48307 235 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 Q8WTZ3 238 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 ST8SIA2Q92186 375 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 GINS3Q9BRX5 216 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 ZFP92A6NM28 416 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IL5P05113 134 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 RD3LP0DJH9 198 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 PSG1P11464 419 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 PAX9P55771 341 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 DEFA1P59665 94 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 DEFA3P59666 94 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TCF24Q7RTU0 167 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SLC35E1Q96K37 410 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SMIM8Q96KF7 97 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 A8MZ25 164 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TSPAN4O14817 238 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 CCNKO75909 580 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 DFFBO76075 338 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IL4P05112 153 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 ZNF90Q03938 601 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 OR2F1Q13607 317 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 C2orf50Q96LR7 162 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 METTL26Q96S19 204 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 VSIRQ9H7M9 311 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PS18 150 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 C7orf66A4D0T2 115 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 PRSS46E5RG02 174 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SIX6O95475 246 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TOMM40O96008 361 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 CRYBB3P26998 211 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 RAB40CQ96S21 281 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SMCO3A2RU48 225 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 OR4C46A6NHA9 309 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 K7EPK0 472 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 L7N2F9 121 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 BMI1P35226 326 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 P2RY1P47900 373 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 BCAP31P51572 246 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 PAFAH1B2P68402 229 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 AKR1C1Q04828 323 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 HAGHQ16775 308 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TRGV9Q99603 122 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.15□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 GOSR2O14653 212 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 PRAF2O60831 178 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 TSC22D2O75157 780 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 TAS2R30P59541 319 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 S100A10P60903 97 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 LYZP61626 148 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 ARL16Q0P5N6 197 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 IL15RAQ13261 267 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-217ENST00000550044 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms