RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544432.5

VAMP1-208, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, human

TSL 3

Gene VAMP1, Length 759 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAMP1-208	ENST00000544432	DLK1	P80370	383 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VAMP1-208	ENST00000544432	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VAMP1-208	ENST00000544432	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VAMP1-208	ENST00000544432	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VAMP1-208	ENST00000544432	NUDT15	Q9NV35	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VAMP1-208	ENST00000544432	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VAMP1-208	ENST00000544432	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
VAMP1-208	ENST00000544432	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432		H3BMM0	161 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432		K7EPK0	472 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SOCS3	O14543	225 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	PSMB3	P49720	205 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	MEOX2	P50222	304 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	PLP1	P60201	277 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SELENOT	P62341	195 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	ASAH1	Q13510	395 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF98	A6NK75	572 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	ISLR	O14498	428 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SCGB1D2	O95969	90 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	GALR1	P47211	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	GPR82	Q96P67	336 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SMCO3	A2RU48	225 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	DEDD	O75618	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	CCNK	O75909	580 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	IL5	P05113	134 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	MIF	P14174	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	ORM2	P19652	201 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C4BPB	P20851	252 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432		L7N2F9	121 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	CCS	O14618	274 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	HYPM	O75409	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	VAMP2	P63027	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	S100A7A	Q86SG5	101 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432		Q8NAQ8	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C2orf50	Q96LR7	162 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C5orf51	A6NDU8	294 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432		H3BRN7	92 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	UPK1B	O75841	260 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	RAP2B	P61225	183 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	IL15RA	Q13261	267 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	RSG1	Q9BU20	258 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	RNF24	Q9Y225	148 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	FAM25E	A8MYX2	175 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	LINC00869	P0C866	280 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432		X6R8D5	127 aa		10.09	□□□□□ -0.79
VAMP1-208	ENST00000544432	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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