RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 POLQO75417 2590 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 PDZD2O15018 2839 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 AKAP9Q99996 3911 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 MPTX1A8MV57 137 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 GPR31O00270 319 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 YPEL1O60688 119 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 MMP23AO75900 390 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 HIST1H4GQ99525 98 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.11□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-214ENST00000530727 IL22RA2Q969J5 263 aa3.11□□□□□ -1.91
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PTPRC-214ENST00000530727 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.11□□□□□ -1.91
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