RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 RAB9BQ9NP90 201 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OSTCQ9NRP0 149 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SPRR3Q9UBC9 169 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 V9GYV3 84 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.13□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 REV3LO60673 3130 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PPV4 95 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 NUPR1O60356 82 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SERF1AO75920 110 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 IGHG3P01860 377 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DQA1P01909 254 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CGB3P0DN86 165 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CGB7P0DN87 165 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CRISP2P16562 243 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 IGHV1-2P23083 117 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CBLN1P23435 193 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 NPY1RP25929 384 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GABRA2P47869 451 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RAB7AP51149 207 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 EDDM3BP56851 147 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 UBE2G2P60604 165 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RHOBP62745 196 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RPEL1Q2QD12 228 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CST9LP1Q5W188 147 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MIC13Q5XKP0 118 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RASL11AQ6T310 242 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZT83 130 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CORO2AQ92828 525 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RNF2Q99496 336 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 VAMP8Q9BV40 100 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PSG11Q9UQ72 335 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.12□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PRE2 83 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 C20orf202A1L168 122 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PSMB11A5LHX3 300 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 A8MXE2 369 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GGTLC3B5MD39 225 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 M0R1X1 148 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ISLRO14498 428 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 FCGR3BO75015 233 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 IGLV2-8P01709 118 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 LINC00869P0C866 280 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 BRS3P32247 399 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ARG2P78540 354 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PRCDQ00LT1 54 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF90Q03938 601 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 AESQ08117 197 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RAB31Q13636 194 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MORN2Q502X0 79 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SPINK9Q5DT21 86 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CENPWQ5EE01 88 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TCF23Q7RTU1 214 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 LRP11Q86VZ4 500 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GCNT2Q8N0V5 402 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR4A16Q8NH70 328 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OCC1Q8TAD7 63 aa3.11□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa3.11□□□□□ -1.91
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