RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF329Q86UD4 541 aa7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 TRGV9Q99603 122 aa7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 SPXQ9BT56 116 aa7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 S4R3C0 116 aa7.22□□□□□ -1.25
TSPAN18-208ENST00000520837 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM223BA6NKX1 122 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 CLN5O75503 358 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV3-23P01764 117 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC00869P0C866 280 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 RD3LP0DJH9 198 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TPPP2P59282 170 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 RHOBP62745 196 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF90Q03938 601 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 C15orf32Q32M92 178 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TIGITQ495A1 244 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 COMMD1Q8N668 190 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TXN2Q99757 166 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 VSIRQ9H7M9 311 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC25A22Q9H936 323 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 GNB4Q9HAV0 340 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A0G2JLM5 398 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 H3BUA1 57 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 HYPMO75409 117 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 YIF1AO95070 293 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 IFNA1P01562 189 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 OR5G3P0C626 314 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 ORM2P19652 201 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 DEFA5Q01523 94 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 DEFA6Q01524 100 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 S100A7AQ86SG5 101 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 Q8WTZ3 238 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 USMG5Q96IX5 58 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 PFDN5Q99471 154 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 RNF2Q99496 336 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TREM1Q9NP99 234 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 DOK5Q9P104 306 aa7.2□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 RAB19A4D1S5 217 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 OR2T8A6NH00 312 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLC1P0CG04 106 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TAS2R45P59539 299 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 LYZP61626 148 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 PEA15Q15121 130 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 SMUG1Q53HV7 270 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 GNG13Q9P2W3 67 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF580Q9UK33 172 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 A4D1N5 150 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 A8MZ25 164 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 CXorf1O96002 111 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 PSG1P11464 419 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 S100A7P31151 101 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 GPR183P32249 361 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 PPT1P50897 306 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM78BQ5VT40 261 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 C1QL4Q86Z23 238 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.18□□□□□ -1.26
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms