RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519686.6

VNN3-212, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-212ENST00000519686 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 APLNQ9ULZ1 77 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 H3BMQ9 156 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 MED6O75586 246 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 IGKV3-20P01619 116 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 IAPPP10997 89 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 TMEM189A5PLL7 270 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 CCDC160A6NGH7 325 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 S100A5P33763 92 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 PSMB3P49720 205 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 EMP1P54849 157 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 OR2F1Q13607 317 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 RNF126Q9BV68 326 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 CELA1Q9UNI1 258 aa6.53□□□□□ -1.36
VNN3-212ENST00000519686 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SLC25A6P12236 298 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 S100A7P31151 101 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 FXYD7P58549 80 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 C12orf74Q32Q52 190 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 TRGV9Q99603 122 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SOSTQ9BQB4 213 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 WRBO00258 174 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 ISLRO14498 428 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SYNGR2O43760 224 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 PITX3O75364 302 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 AMBPP02760 352 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 P0DMU3 169 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 FAM231AP0DMU4 169 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 FAM231CP0DMU5 169 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 GALR1P47211 349 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 INPP1P49441 399 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 MEOX2P50222 304 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 AKR1C1Q04828 323 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 LRTM2Q8N967 370 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 TRIM63Q969Q1 353 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 C16orf92Q96LL3 132 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 NEU1Q99519 415 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SLC25A22Q9H936 323 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 RPRMQ9NS64 109 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 RFNGQ9Y644 331 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SFT2D2O95562 160 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 HOXB5P09067 269 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 DEFB1P60022 68 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 PSG9Q00887 426 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 PPP1R1AQ13522 171 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 FAM78BQ5VT40 261 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 THAP8Q8NA92 274 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 V9GYH0 126 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SMCO3A2RU48 225 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 H3BP45 60 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 SOCS3O14543 225 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 IFNA21P01568 189 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-212ENST00000519686 HBE1P02100 147 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms