RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	MT-CO2	P00403	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SPP1	P10451	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MIF	P14174	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PRSS3	P35030	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	HRH1	P35367	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS2R20	P59543	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	DEDD	O75618	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	APOA1	P02647	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PMP2	P02689	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TBP	P20226	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RCVRN	P35243	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RND3	P61587	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552		Q8NAQ8	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	HELT	A6NFD8	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552		P0C879	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CRYBB3	P26998	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SNCA	P37840	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TFPI2	P48307	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPAN5	P62079	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NEDD8	Q15843	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	STH	Q8IWL8	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552		K7EQG2	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CLN5	O75503	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM50A	O95807	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	FCER2	P06734	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NPPC	P23582	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	AKR1C2	P52895	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFB131A	P59861	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	OPCML	Q14982	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	METTL26	Q96S19	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GU03	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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