RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 HLA-EP13747 358 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP10-10P60014 251 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 SARNPP82979 210 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 OR4D11Q8NGI4 311 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 OR2T10Q8NGZ9 312 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 MAFIPQ8WZ33 124 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 TTTY12Q9BZ98 90 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 BCL2L10Q9HD36 194 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 JPT1Q9UK76 154 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 STRCQ7RTU9 1775 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ARHGEF10O15013 1369 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 SBF1O95248 1867 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 BCL9O00512 1426 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 LY6LH3BQJ8 138 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 K7ERJ3 54 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 FAM107AO95990 144 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 C1QCP02747 245 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 OR10J4P0C629 311 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ZNF826PQ6ZT77 177 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 IFT20Q8IY31 132 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 Q8IYB0 196 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 MICAL3Q7RTP6 2002 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 MYH10P35580 1976 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ARL5CA6NH57 179 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 H3BRN7 92 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 OVOL1O14753 267 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 CST7O76096 145 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 UBBP0CG47 229 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 S100A12P80511 92 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 SMARCA4P51532 1647 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 PXDNLA1KZ92 1463 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ARAP1Q96P48 1450 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 DEGS1O15121 323 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 TIMM17BO60830 172 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 GADD45GO95257 159 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 DHFRP00374 187 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 HBBP68871 147 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ZNF846Q147U1 533 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ESRGQ1W209 222 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 PATE2Q6UY27 113 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 PLXNA3P51805 1871 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa2.35□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 J3KT08 172 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 LYZL6O75951 148 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 P0DMU3 169 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 FAM231AP0DMU4 169 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 FAM231CP0DMU5 169 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP5-9P26371 169 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 MYL5Q02045 173 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 OR8B8Q15620 311 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 TMEM229BQ8NBD8 167 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ZNF714Q96N38 554 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 GSKIPQ9P0R6 139 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 HS3ST2Q9Y278 367 aa2.34□□□□□ -2.03
HERC3-209ENST00000504994 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa2.34□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TAF1LQ8IZX4 1826 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 GLI3P10071 1580 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 A8MWV9 139 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 ASAH2BP0C7U1 165 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 FABP2P12104 132 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 SMCO1Q147U7 214 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 RASL12Q9NYN1 266 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 HIST1H2BKO60814 126 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 HIST1H2BJP06899 126 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP10-1P60331 282 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 Q1T7F1 81 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 OR4K15Q8NH41 348 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 CEP152O94986 1710 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 A0A1B0GX51 115 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 B4DSR2 109 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 RER1O15258 196 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 MIFP14174 115 aa2.31□□□□□ -2.04
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