RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 CTSGP08311 255 aa6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 PF4V1P10720 104 aa6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 AWAT1Q58HT5 328 aa6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 LEMD1Q68G75 181 aa6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 CD5LO43866 347 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 HNF1AP20823 631 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 KLK9Q2XQG4 91 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 SUN5Q8TC36 379 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 TVP23CQ96ET8 276 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 DUX5Q96PT3 197 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 PARLQ9H300 379 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 H3BUA1 57 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 OR2C1O95371 312 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 BLNKQ8WV28 456 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 NDUFB4O95168 129 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 AKR1C3P42330 323 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 CCDC140Q96MF4 163 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 A0A1W2PRE2 83 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 BMPR1BO00238 502 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 S100A7P31151 101 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 ADMP35318 185 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 RHEBQ15382 184 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF329Q86UD4 541 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 FXYD5Q96DB9 178 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 USMG5Q96IX5 58 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 RABAC1Q9UI14 185 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 A0A0G2JLM5 398 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 TGOLN2O43493 480 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 RANP62826 216 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 NAT8Q9UHE5 227 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG16-202ENST00000493536 AKAP9Q99996 3911 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 A6NJY4 79 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF98A6NK75 572 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 H3BRN7 92 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 IGHV3-11P01762 117 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 SLC35B1P78383 322 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 ADIRFQ15847 76 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 DERL1Q9BUN8 251 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 KLK15Q9H2R5 256 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 GGTLC3B5MD39 225 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 PPP5D1E7EU14 171 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 BRI3O95415 125 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 IGLV1-40P01703 118 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 PF4P02776 101 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 GP9P14770 177 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 NPPCP23582 126 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 CRYBB3P26998 211 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 ARL3P36405 182 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 RAB9AP51151 201 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 LINC01559Q495D7 138 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 ATP6V0BQ99437 205 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF580Q9UK33 172 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 RNF24Q9Y225 148 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 H3BTX0 84 aa6.82□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 SCGB2A2Q13296 93 aa6.82□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.82□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.82□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 HELTA6NFD8 242 aa6.82□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 B4DEV8 164 aa6.82□□□□□ -1.32
SNHG16-202ENST00000493536 TSPAN4O14817 238 aa6.82□□□□□ -1.32
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