RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR5B12Q96R08 314 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFT46Q9NQC8 304 aa3.1□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.09□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 UPK2O00526 184 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 PTTG1O95997 202 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV1-5P01602 117 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RRASP10301 218 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPA2P15927 270 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TAS2R46P59540 309 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR2B8PP59922 312 aa3.09□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SSX9Q7RTT3 188 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR11H1Q8NG94 326 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4S2Q8NH73 311 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 DCUN1D4Q92564 292 aa3.09□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TP53RKQ96S44 253 aa3.09□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.09□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 BET1LQ9NYM9 111 aa3.09□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 RGS5O15539 181 aa3.08□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 OR2A4O95047 310 aa3.08□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 F2RP25116 425 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 UCP1P25874 307 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CD40LGP29965 261 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC6A1P30531 599 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 G6PCP35575 357 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 LPAR6P43657 344 aa3.08□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TPPP2P59282 170 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 RND3P61587 244 aa3.08□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 AARDQ4LEZ3 155 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.08□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 MCFD2Q8NI22 146 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 AP3S1Q92572 193 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 MARC2Q969Z3 335 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR2A7Q96R45 310 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPR132Q9UNW8 380 aa3.08□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.07□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.07□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.07□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP5D1E7EU14 171 aa3.07□□□□□ -1.92
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