RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	BMPR1B	O00238	502 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	RAB9A	P51151	201 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	C11orf52	Q96A22	123 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304		H3BRN7	92 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	TGOLN2	O43493	480 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	ATP5G3	P48201	142 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	CFHR3	Q02985	330 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	ATRAID	Q6UW56	229 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	PARL	Q9H300	379 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	SCO1	O75880	301 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	GPR183	P32249	361 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	TPPP2	P59282	170 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	AWAT1	Q58HT5	328 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304		S4R3C0	116 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TAPBP-238	ENST00000475304	CLEC3B	P05452	202 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	RABAC1	Q9UI14	185 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304		A0A087WWC5	75 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	IGHG4	P01861	327 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	OR10J4	P0C629	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	GP9	P14770	177 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ADM	P35318	185 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	SLC35B1	P78383	322 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	BTN1A1	Q13410	526 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	PYY	P10082	97 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	PF4V1	P10720	104 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304		Q8N2B8	174 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ZAN	Q9Y493	2812 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	NDUFB4	O95168	129 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304		Q6ZS46	218 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	GPR82	Q96P67	336 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304		C9JCJ5	164 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ELANE	P08246	267 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	PSMB8	P28062	276 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	PDE6H	Q13956	83 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	CLDN34	H7C241	214 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	NPPC	P23582	126 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	ARL3	P36405	182 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	CXorf65	A6NEN9	183 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	MYCNOS	P40205	109 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	FOXE3	Q13461	319 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TAPBP-238	ENST00000475304	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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