RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 XCL2Q9UBD3 114 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 CD5P06127 495 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 FXYD7P58549 80 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 C17orf77Q96MU5 243 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 METTL26Q96S19 204 aa7.72□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 NACAE9PAV3 2078 aa7.71□□□□□ -1.17
NISCH-206ENST00000474188 HMSDA8MTL9 139 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SIX6O95475 246 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SFT2D2O95562 160 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 IFNA17P01571 189 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 UCP1P25874 307 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SNCAP37840 140 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 OPRK1P41145 380 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SLC35G3Q8N808 338 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 GPR146Q96CH1 333 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 HSPB11Q9Y547 144 aa7.71□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 A0A1W2PS18 150 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 HELTA6NFD8 242 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 GOSR2O14653 212 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 BUB3O43684 328 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 PRM2P04554 102 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 PGAM2P15259 253 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 RND2P52198 227 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 ZNF709Q8N972 641 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 PRR13Q9NZ81 148 aa7.7□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SOCS3O14543 225 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 IGKV3-20P01619 116 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 HLA-DRB4P13762 266 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 AKR1C4P17516 323 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 CXCL2P19875 107 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 AKR1C2P52895 323 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 IL15RAQ13261 267 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 F6UB75 175 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 CORTO00230 105 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 ATP6V1G1O75348 118 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 CDS2O95674 445 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 OR5AC1P0C628 307 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 P0DMU3 169 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 FAM231AP0DMU4 169 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 FAM231CP0DMU5 169 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 PSG1P11464 419 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SLC25A4P12235 298 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 OR10J1P30954 320 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 EMP1P54849 157 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 C2orf83Q53S99 150 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 LRTM2Q8N967 370 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 NPIPB3Q92617 1050 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 C20orf173Q96LM9 149 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 DKK2Q9UBU2 259 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 CACNG5Q9UF02 275 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 MPC2O95563 127 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 IL4P05112 153 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 VAMP1P23763 118 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SPCS3P61009 180 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 TNP2Q05952 138 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 NDUFA5Q16718 116 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 OR52E5Q8NH55 327 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 NEU1Q99519 415 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 NMES1Q9C002 83 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 NRN1Q9NPD7 142 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 MYCBP2O75592 4640 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 CCSO14618 274 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 TOMM40O96008 361 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 S100GP29377 79 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 ZNF90Q03938 601 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 COQ8AQ8NI60 647 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 Q8WTZ3 238 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
NISCH-206ENST00000474188 NAA60Q9H7X0 242 aa7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms