RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 CT45A1Q5HYN5 189 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00596Q86U02 117 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 SAXO1Q8IYX7 474 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 GAFA1Q96PS6 74 aa4.84□□□□□ -1.63
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM140Q9NV12 185 aa4.84□□□□□ -1.63
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SHQ1-205ENST00000468371 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.84□□□□□ -1.63
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SHQ1-205ENST00000468371 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa4.84□□□□□ -1.63
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SHQ1-205ENST00000468371 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.84□□□□□ -1.63
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SHQ1-205ENST00000468371 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.84□□□□□ -1.64
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SHQ1-205ENST00000468371 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.83□□□□□ -1.64
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SHQ1-205ENST00000468371 IGKV1D-39P04432 117 aa4.82□□□□□ -1.64
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SHQ1-205ENST00000468371 CT45A10P0DMU9 189 aa4.82□□□□□ -1.64
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SHQ1-205ENST00000468371 Q6ZWC4 215 aa4.82□□□□□ -1.64
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SHQ1-205ENST00000468371 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.82□□□□□ -1.64
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SHQ1-205ENST00000468371 CD177Q8N6Q3 437 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 MDFIQ99750 246 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 PSMB11A5LHX3 300 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 PGPA6NDG6 321 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-205ENST00000468371 K7ERU9 68 aa4.82□□□□□ -1.64
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