RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465894.6

SH3BP5-209, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-209ENST00000465894 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.41□□□□□ -0.74
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SH3BP5-209ENST00000465894 PDE6DO43924 150 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP5-209ENST00000465894 IGKV1-17P01599 117 aa10.4□□□□□ -0.74
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SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.38□□□□□ -0.75
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SH3BP5-209ENST00000465894 BTF3L4Q96K17 158 aa10.38□□□□□ -0.75
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SH3BP5-209ENST00000465894 SMUG1Q53HV7 270 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 GCSAMLQ5JQS6 135 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.36□□□□□ -0.75
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SH3BP5-209ENST00000465894 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 A0A1B0GUS0 222 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 ZNF727A8MUV8 499 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 PPP5D1E7EU14 171 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 IL4P05112 153 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 STAG3L2P0CL84 134 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 STAG3L3P0CL85 134 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 CD81P60033 236 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 FAM78BQ5VT40 261 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 PATE2Q6UY27 113 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 SSX7Q7RTT5 188 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 TMEM37Q8WXS4 190 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 RNF125Q96EQ8 232 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP5-209ENST00000465894 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
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