RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 RNF5Q99942 180 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RAB4AP20338 218 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 MLST8Q9BVC4 326 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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SYNE4-204ENST00000465425 P01737 135 aa14.58□□□□□ -0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 MMDQ15546 238 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A8MWL6 223 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 TIMM23O14925 209 aa14.57□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.57□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.57□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 HSBP1O75506 76 aa14.57□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TCF24Q7RTU0 167 aa14.57□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 M0QZK8 103 aa14.56□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TCAPO15273 167 aa14.56□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 C3orf79P0CE67 100 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 HTR1DP28221 377 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CT83Q5H943 113 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 NIT1Q86X76 327 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 Q8N976 141 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SIAH2O43255 324 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 OR2J3O76001 311 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF492Q9P255 531 aa14.55□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1B0GXF2 115 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 VWC2LB2RUY7 222 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CCL21O00585 134 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TOX4O94842 621 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ARF6P62330 175 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TIMD4Q96H15 378 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 DPM3Q9P2X0 92 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ABCA1O95477 2261 aa14.54□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TACC2O95359 2948 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1-17P01599 117 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA45Q537H7 98 aa14.53□□□□□ -0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 M0R2Z0 102 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 NBR2O15453 112 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 LY6HO94772 140 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 COL8A1P27658 744 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CEACAM3P40198 252 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 Q86TA4 180 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.53□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.53□□□□□ -0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.52□□□□□ -0.08
SYNE4-204ENST00000465425 GTSF1Q8WW33 167 aa14.52□□□□□ -0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 SPTA1P02549 2419 aa14.51□□□□□ -0.09
SYNE4-204ENST00000465425 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SYNE4-204ENST00000465425 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.5□□□□□ -0.09
SYNE4-204ENST00000465425 A6NNC1 897 aa14.5□□□□□ -0.09
SYNE4-204ENST00000465425 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.5□□□□□ -0.09
SYNE4-204ENST00000465425 FAM231BA6NCW3 169 aa14.49□□□□□ -0.09
SYNE4-204ENST00000465425 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.49□□□□□ -0.09
SYNE4-204ENST00000465425 IL4P05112 153 aa14.49□□□□□ -0.09
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