RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 NUDT11Q96G61 164 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 KCNS1Q96KK3 526 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 MLST8Q9BVC4 326 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 THYN1Q9P016 225 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 PLCE1Q9P212 2302 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 TEX22C9J3V5 150 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 NDUFA3O95167 84 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 MOSP00540 346 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 LTAP01374 205 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 IGLC1P0CG04 106 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 RD3LP0DJH9 198 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 PDE6HQ13956 83 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 PLGLAQ15195 96 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 MMDQ15546 238 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 Q6AWC8 147 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 BORCS7Q96B45 105 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 TBX15Q96SF7 602 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 TXN2Q99757 166 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 PRO1933Q9H354 126 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 GNB4Q9HAV0 340 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 I3L2K1 104 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 NBR2O15453 112 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 GOSR1O95249 250 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 CNIH1O95406 144 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 P01737 135 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 TCRAP04437 139 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 OR5AL1P0C617 328 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 PYYP10082 97 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 GP9P14770 177 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 COL8A2P25067 703 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 RAB9AP51151 201 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 MFAP2P55001 183 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 HCP5Q6MZN7 132 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 NUP35Q8NFH5 326 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 VAMP8Q9BV40 100 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 C1RLQ9NZP8 487 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 CHD6Q8TD26 2715 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 TNCP24821 2201 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 KALRNO60229 2985 aa6.78□□□□□ -1.32
ACTB-208ENST00000464611 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 BMPR1BO00238 502 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RNF224P0DH78 156 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 PSG1P11464 419 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 AMTP48728 403 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 MFAP4P55083 255 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 HBBP68871 147 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 PSG9Q00887 426 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 EBI3Q14213 229 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CDSNQ15517 529 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 MORN5Q5VZ52 161 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 Q9H3A6 140 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 NRN1Q9NPD7 142 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.77□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GXF2 115 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PS18 150 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 ODF3BA8MYP8 253 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 DIRC3C9JPN6 131 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 NUPR1O60356 82 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 HSBP1O75506 76 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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