RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB103AP81534 67 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 Q1T7F1 81 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 TOMM20LQ6UXN7 152 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 MBD3L1Q8WWY6 194 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 LRTM1Q9HBL6 345 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL2L10Q9HD36 194 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 C19orf12Q9NSK7 152 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TSTD3H0UI37 97 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 MIFP14174 115 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 GPX2P18283 190 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM128Q5BJH2 165 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC30A7Q8NEW0 376 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 GRPEL2Q8TAA5 225 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 EFCAB11Q9BUY7 163 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CST9LQ9H4G1 147 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 NCAPD3P42695 1498 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 E7EQ34 232 aa2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 ELOBQ15370 118 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 Q8IYB0 196 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 PYDC1Q8WXC3 89 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 NPCDR1Q9BY65 106 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 POPDC3Q9HBV1 291 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.2□□□□□ -2.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 MEIKINA0A087WXM9 373 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ASAH2BP0C7U1 165 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 UBBP0CG47 229 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 HLA-EP13747 358 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 S100GP29377 79 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ARPP19P56211 112 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SARNPP82979 210 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 PLCXD2Q0VAA5 305 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ALX1Q15699 326 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 RTL8BQ17RB0 113 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ESRGQ1W209 222 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 PCOTHQ58A44 107 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 PATE2Q6UY27 113 aa2.19□□□□□ -2.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 THEM6Q8WUY1 208 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC32Q9BV29 185 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 GINS2Q9Y248 185 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 HS3ST2Q9Y278 367 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF11Q9Y3C5 154 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ASB4Q9Y574 426 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ODAMA1E959 279 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TIMM17BO60830 172 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 GADD45GO95257 159 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SAMD13Q5VXD3 122 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 OTORQ9NRC9 128 aa2.18□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 FUOMA2VDF0 154 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 AKR1C3P42330 323 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SSR2P43308 183 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TMBIM6P55061 237 aa2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.17□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 A8MWV9 139 aa2.16□□□□□ -2.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP12-1P59990 96 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC115Q96NT0 180 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.16□□□□□ -2.06
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