RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444609.1

HDAC8-215, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC8, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-215ENST00000444609 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 RAB22AQ9UL26 194 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 TOMM40O96008 361 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 RD3LP0DJH9 198 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 SRIP30626 198 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 OR10J1P30954 320 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 FCGR2CP31995 323 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 OR4A16Q8NH70 328 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 K7EQD1 137 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 PPYP01298 95 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 MYL12AP19105 171 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 MEOX2P50222 304 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 SPINK9Q5DT21 86 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 HACD4Q5VWC8 232 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 WDR73Q6P4I2 378 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 THAP8Q8NA92 274 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 APH1BQ8WW43 257 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 C8orf49Q96NF6 230 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 FUT9Q9Y231 359 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 A0A087WXM4 84 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 OR5AC1P0C628 307 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 PSMB9P28065 219 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 WNT4P56705 351 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 RHOBP62745 196 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 LAGE3Q14657 143 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 PSG3Q16557 428 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 SPARTQ8N0X7 666 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 BLNKQ8WV28 456 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 IL22RA2Q969J5 263 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 IGHV3-53P01767 116 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 PSG1P11464 419 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 RND2P52198 227 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 FHL2Q14192 279 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDAC8-215ENST00000444609 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 E5RGE8 158 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 EI24O14681 340 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RLN1P04808 185 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 PTHLHP12272 177 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 FXYD4P59646 89 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 OR2F1Q13607 317 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IRGMA1A4Y4 181 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 NXPH3O95157 252 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IGHV3-30P01768 117 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IGHV3-33P01772 117 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 UCHL1P09936 223 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SCAND1P57086 179 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ARL6IP1Q15041 203 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 CDNFQ49AH0 187 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 CYGBQ8WWM9 190 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SEC22AQ96IW7 307 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 CCDC160A6NGH7 325 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SLC25A4P12235 298 aa6.44□□□□□ -1.38
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