RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 F2Z2F3 143 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDUFA3O95167 84 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IL4P05112 153 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF224P0DH78 156 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARPC1AQ92747 370 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TBX15Q96SF7 602 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SIRPDQ9H106 197 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBE2G1P62253 170 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPBQ8NG41 125 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q9H3A6 140 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EPDR1Q9UM22 224 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2J3O76001 311 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CD33P20138 364 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LMO4P61968 165 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BTF3L4Q96K17 158 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZANQ9Y493 2812 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV4-39P01824 125 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SAA4P35542 130 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAX2Q02962 417 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GNG7O60262 68 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYCNOSP40205 109 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ECSCRQ19T08 205 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q56UQ5 140 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRO1933Q9H354 126 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OSTCQ9NRP0 149 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2T8A6NH00 312 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC01548A6NM66 108 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDUFB8O95169 186 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF562Q6V9R5 426 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUDT11Q96G61 164 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRB1P04280 392 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NRGNQ92686 78 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TAS2R60P59551 318 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM219Q86XT9 240 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF125Q96EQ8 232 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AJUBAQ96IF1 538 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTPN13Q12923 2485 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 F8W735 103 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDLIM4P50479 330 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLP1P60201 277 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q8N6K4 173 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q8N9W7 124 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 M0R3E3 92 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCRAP04437 139 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GZMBP10144 247 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 G3V318 75 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CRISP2P16562 243 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00310P59036 64 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCF24Q7RTU0 167 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRNTQ86SH4 94 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATG101Q9BSB4 218 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAMPP49913 170 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 S100A12P80511 92 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SERF1AO75920 110 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms