RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PPB8 328 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGKCP01834 107 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 CECR9P0C854 216 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 MPV17L2Q567V2 206 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF14Q92956 283 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SP9P0CG40 484 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RNF125Q96EQ8 232 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.233e-7■■■□□ 18.6
PTPRM-202ENST00000400053 CELA3BP08861 270 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf79P0CE67 100 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 FOXL1Q12952 345 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 MST1LQ2TV78 715 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 METRNQ9UJH8 293 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 EPDR1Q9UM22 224 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 LILRA1O75019 489 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 OR9G9P0C7N8 305 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PSG8Q9UQ74 426 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GW64 132 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 YPEL1O60688 119 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 YPEL2Q96QA6 119 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 hDV102S1A0JD36 115 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf63A6NC05 138 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PAX4O43316 350 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 DSCR9P59020 149 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 TREML4Q6UXN2 200 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087X0K7 114 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 C17orf100A8MU93 164 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 A8MWP6 167 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 NMSQ5H8A3 153 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GUS0 222 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PI4KAP42356 2102 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2V1Q13404 147 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 GATD1Q8NB37 220 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 DOCK7Q96N67 2140 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 AGMATQ9BSE5 352 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 CCL3L1P16619 93 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 CRYGSP22914 178 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01560Q8TB33 94 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TSKUQ8WUA8 353 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 COL4A6Q14031 1691 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 C15orf61A6NNL5 157 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-5P01602 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 RASL11AQ6T310 242 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 NOTCH4Q99466 2003 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 OOSP1A8MZH6 123 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.32□□□□□ -1.24
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