RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 RPEL1Q2QD12 228 aa22.68■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 TIGITQ495A1 244 aa22.68■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 SCGB2A1O75556 95 aa22.68■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 CITED4Q96RK1 184 aa22.68■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 M0QZ24 198 aa22.67■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 UQCC3Q6UW78 93 aa22.67■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 ANK2Q01484 3957 aa22.66■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 PF4P02776 101 aa22.66■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 FABP1P07148 127 aa22.66■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF90Q03938 601 aa22.66■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 FAM122CQ6P4D5 195 aa22.66■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa22.65■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 S100A1P23297 94 aa22.65■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 GCSAMLQ5JQS6 135 aa22.65■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA3Q8NHX4 192 aa22.65■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 RAB24Q969Q5 203 aa22.65■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa22.65■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 WNK1Q9H4A3 2382 aa22.64■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PPV4 95 aa22.64■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 RHOBP62745 196 aa22.64■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 RELQ04864 619 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 SSX7Q7RTT5 188 aa22.64■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF414Q96IQ9 312 aa22.64■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A22Q9H936 323 aa22.64■■□□□ 1.22
ECHS1-201ENST00000368547 GATAD1Q8WUU5 269 aa22.64■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 RNF2Q99496 336 aa22.64■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 PLP1P60201 277 aa22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 PMS2P11Q13670 270 aa22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF600Q6ZNG1 722 aa22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 GPHB5Q86YW7 130 aa22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 OR1L4Q8NGR5 311 aa22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 PFDN5Q99471 154 aa22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 VWFP04275 2813 aa22.63■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 SYNJ2BPP57105 145 aa22.62■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 LCN15Q6UWW0 184 aa22.62■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 FAM210AQ96ND0 272 aa22.62■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 OR5G3P0C626 314 aa22.61■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 FAM106AQ4KMX7 169 aa22.61■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 PBDC1Q9BVG4 233 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFA4O00483 81 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 TOMM40O96008 361 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 RD3LP0DJH9 198 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 PSG1P11464 419 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 CCL20P78556 96 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 C1QL4Q86Z23 238 aa22.6■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa22.59■■□□□ 1.21
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ECHS1-201ENST00000368547 STAG3L2P0CL84 134 aa22.59■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 STAG3L3P0CL85 134 aa22.59■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00482Q8N8I6 264 aa22.59■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 Q8WTZ3 238 aa22.59■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 FUT9Q9Y231 359 aa22.59■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 DNHD1Q96M86 4753 aa22.58■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 TOMM20LQ6UXN7 152 aa22.58■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM37Q8WXS4 190 aa22.58■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 SCRT1Q9BWW7 348 aa22.58■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ECHS1-201ENST00000368547 FAM78BQ5VT40 261 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM190Q8WZ59 177 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 C20orf24Q9BUV8 137 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 SMDT1Q9H4I9 107 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GV50 99 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 COX7A2P2O60397 106 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 CD5P06127 495 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 GUK1Q16774 197 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 ZFAND3Q9H8U3 227 aa22.57■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 LGALS9O00182 355 aa22.56■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 C10orf113Q5VZT2 155 aa22.56■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 REC114Q7Z4M0 266 aa22.56■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 OR51G1Q8NGK1 321 aa22.56■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa22.55■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 OVOL1O14753 267 aa22.55■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 CXorf1O96002 111 aa22.55■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 IL4P05112 153 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 PSMB3P49720 205 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 PPT1P50897 306 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R45P59539 299 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 PEA15Q15121 130 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 PATE2Q6UY27 113 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 RBFOX3A6NFN3 312 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 HYPMO75409 117 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 OR9G4Q8NGQ1 327 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 IFNA1P01562 189 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 KRBOX1C9JBD0 128 aa22.52■■□□□ 1.2
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